復合堿也有很明顯的弊端，復合堿中的氫氧化鈣為難溶物，如果汙水呈酸性時，可以溶解於水中，當汙水呈中性或堿性時，氫氧化鈣將形成沈澱，因此使用復合堿產生的汙泥要遠遠大於氫氧化鈉，由於現在汙泥的處理成本不斷上漲，汙泥量大，汙泥處理成本自然就更高。因此，實際上復合堿的使用成本是否低於氫氧化鈉還需要仔細核算。